В настоящее время в составе РЗК насчитывается более двух десятков первичных организаций. В течение 2007-2008 гг. созданы подразделения в Самарской, Оренбургской и Московской областях, в г. Северодвинске Архангельской области и Москве. Практически во всех территориях, где имеются арсеналы хранения химического оружия (ХО), действуют районные отделения Зелёного креста.
Зелёный крест ориентирует свои региональные организации на выявление причин возникновения избыточных техногенных воздействий на окружающую среду, осуществление мероприятий по снижению их влияния на биосферу. В центре внимания Зелёного креста находились вопросы воспитания у населения умения жить и развиваться в соответствии с законами природы, сохранения её для потомков с тем же ресурсным потенциалом планеты, которым человечество владеет сегодня.
Встречи с населением, его информированность о состоянии окружающей среды, организация летней оздоровительной компании с детьми, проживающими в экологически неблагополучных районах, лекции, беседы, круглые столы, конкурсы, викторины, тематические походы и экскурсии, теоретические и практические занятия, экологические посты прочно вошли в практику работы территориальных организаций Зелёного креста.